More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  68.49 
 
 		 492 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 512 aa  1027    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  56.06 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  53.8 
 
 		 496 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  53.8 
 
 		 496 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  53.8 
 
 		 496 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 		 496 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  53.12 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  53.97 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  51.99 
 
 		 508 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  51.93 
 
 		 501 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  50.58 
 
 		 500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  50.1 
 
 		 501 aa  465  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  51.8 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 497 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  52.92 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  51.67 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 		 509 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  47.86 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 		 520 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 		 487 aa  405  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 		 521 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 517 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 489 aa  338  9e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 490 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 497 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  35.25 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 502 aa  257  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 465 aa  187  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 470 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 475 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 478 aa  136  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 1093 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 1093 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  29.39 
 
 		 918 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.73 
 
 		 1239 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 3706 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 839 aa  117  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 1654 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.07 
 
 		 744 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 732 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1253 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 215 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.26 
 
 		 754 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 1227 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 945 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.67 
 
 		 1248 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 924 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 815 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 572 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 991 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 2693 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 1390 aa  107  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.17 
 
 		 783 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1047 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 767 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1714 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  31.28 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 636 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1560 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 681 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 932 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1051 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 771 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 819 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.52 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 964 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 682 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 941 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 704 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 1676 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 674 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 856 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.3 
 
 		 676 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 551 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 912 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 461 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1210 aa  96.7  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 936 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 747 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 1177 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 727 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>