More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20510 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 497 aa  988    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  50.89 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  49.5 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  46.14 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 495 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 497 aa  336  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  40.86 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 503 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 521 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 509 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  41.05 
 
 		 491 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  39.73 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 496 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 496 aa  299  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 496 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 496 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 492 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 492 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  39.96 
 
 		 500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 512 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 490 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 494 aa  276  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  39.12 
 
 		 516 aa  266  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 520 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  24.33 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.62 
 
 		 744 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.87 
 
 		 1239 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 636 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 215 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 603 aa  97.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 570 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 1227 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 647 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 856 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 1390 aa  95.1  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 681 aa  94.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  28.57 
 
 		 624 aa  93.2  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 526 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 945 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 400 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 834 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 408 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 991 aa  89.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 1253 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 613 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 1051 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 358 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 839 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 815 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 666 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 358 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 1093 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 551 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  32.23 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 771 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 790 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 932 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 875 aa  87  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 924 aa  87.4  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.36 
 
 		 754 aa  87  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.48 
 
 		 895 aa  87  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  27.19 
 
 		 918 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 420 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 674 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  30.6 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 662 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 913 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 1654 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 572 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 874 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 631 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 832 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 878 aa  83.6  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 3706 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 912 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>