More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4087 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 508 aa  1004    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  93.5 
 
 		 516 aa  922    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  61.75 
 
 		 492 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  53.68 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  57.59 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  51.99 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  53.7 
 
 		 521 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  53.47 
 
 		 497 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  53.05 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  52.79 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  52.29 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 		 520 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  50.59 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  51.87 
 
 		 487 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  53.77 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  49.51 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  51 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 		 492 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 484 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  46.47 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 502 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  37.22 
 
 		 494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 480 aa  269  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 497 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 492 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  24.8 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 3706 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.48 
 
 		 744 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 1093 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 1093 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 215 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 613 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 1654 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 945 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 839 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 2693 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 1227 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 382 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1210 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 991 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 1183 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 909 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 732 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 1560 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.86 
 
 		 754 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 681 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 1051 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 647 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.76 
 
 		 918 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 1239 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 1390 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 932 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  32.5 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 771 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 674 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 941 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 551 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 878 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 764 aa  100  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 408 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.05 
 
 		 783 aa  99.8  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 1676 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1182 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 1253 aa  99  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 723 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 682 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.22 
 
 		 1248 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  29 
 
 		 1047 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 636 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 767 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 1714 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.23 
 
 		 1663 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 912 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 945 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>