More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0889 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  100 
 
 		 475 aa  941    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 465 aa  286  5.999999999999999e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 511 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 521 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 512 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 496 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 496 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 496 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  24.21 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 478 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  25.89 
 
 		 501 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 492 aa  143  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 493 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 517 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 514 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  21.54 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 		 497 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 492 aa  133  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  25.21 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 		 500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  21.66 
 
 		 490 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  24.54 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  23.11 
 
 		 516 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  22.79 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  22.65 
 
 		 509 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 497 aa  123  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  22.57 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  21.54 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 487 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 489 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 613 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  30.64 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 636 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  32.91 
 
 		 918 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.26 
 
 		 754 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.18 
 
 		 744 aa  100  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 1676 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 764 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 353 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 551 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 1560 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1093 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 1093 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 3706 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 771 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1182 aa  93.2  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1654 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.34 
 
 		 1239 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 360 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 2693 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.71 
 
 		 676 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 1714 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 815 aa  90.9  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 361 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 788 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  30.17 
 
 		 657 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 991 aa  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 945 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 363 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1227 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 647 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 362 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 547 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 936 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 886 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 732 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 532 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 461 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.24 
 
 		 1668 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 964 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 1047 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1289 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 872 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.78 
 
 		 1663 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 767 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 912 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  30.45 
 
 		 624 aa  84  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 945 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>