More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3796 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 500 aa  991    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  59.18 
 
 		 493 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  57.43 
 
 		 492 aa  541  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  58.91 
 
 		 492 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  59.22 
 
 		 517 aa  531  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  57.02 
 
 		 484 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  55.53 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  52.75 
 
 		 490 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  51.72 
 
 		 489 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  52.85 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  52.85 
 
 		 491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  51.84 
 
 		 521 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 514 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 		 487 aa  438  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 		 490 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 492 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  48.43 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  48.69 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  48.1 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 		 512 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  48.52 
 
 		 511 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 		 497 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  45.26 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 494 aa  359  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 495 aa  358  9e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 500 aa  356  5.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 		 496 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  44.62 
 
 		 501 aa  349  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  42.51 
 
 		 494 aa  343  4e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 496 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 478 aa  163  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  24.02 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 613 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 1654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 1239 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 572 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 3706 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.96 
 
 		 754 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 991 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.17 
 
 		 1663 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  29.31 
 
 		 918 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 681 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 551 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 945 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 294 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 636 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 526 aa  103  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 1093 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 408 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.69 
 
 		 1668 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 871 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 1093 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.77 
 
 		 783 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 603 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  30.51 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.67 
 
 		 744 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 875 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 815 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.11 
 
 		 1248 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 1183 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 1714 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.92 
 
 		 348 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 878 aa  97.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.04 
 
 		 895 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 839 aa  97.8  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 771 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 723 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  34.52 
 
 		 341 aa  97.4  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 945 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 732 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 1390 aa  96.7  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 348 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 874 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 570 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 349 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 856 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 647 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  29.63 
 
 		 657 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 215 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 872 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 1093 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>