More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 480 aa  929    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  44.56 
 
 		 517 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 493 aa  319  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 514 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 484 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 489 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 492 aa  310  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 490 aa  309  9e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 497 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 503 aa  296  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 490 aa  295  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  43.4 
 
 		 491 aa  289  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 509 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 500 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  40.36 
 
 		 516 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 487 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 495 aa  263  4e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  39.14 
 
 		 501 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 496 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 496 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 496 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 501 aa  257  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 512 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 494 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 511 aa  250  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  37.57 
 
 		 500 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  35.45 
 
 		 494 aa  249  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 492 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.66 
 
 		 754 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 945 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  28.79 
 
 		 918 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 3706 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 382 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 541 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 682 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 616 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 572 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  25.73 
 
 		 475 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.38 
 
 		 676 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 834 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 752 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 215 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 709 aa  87.8  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 462 aa  87  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 1093 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 662 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 647 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 815 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 756 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 1093 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 613 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 1047 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 636 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 892 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 1093 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.15 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.09 
 
 		 783 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 871 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 681 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1182 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.09 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  26.05 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 839 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 864 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 991 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 832 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 774 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 723 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 551 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.44 
 
 		 1248 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 746 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>