More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1292 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 492 aa  999    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 465 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  32.98 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  28.37 
 
 		 491 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 508 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  30.04 
 
 		 516 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 		 497 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  30.15 
 
 		 501 aa  179  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  27.96 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 520 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 496 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 509 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 496 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 496 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 502 aa  170  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 500 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 494 aa  169  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 478 aa  166  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 487 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 484 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  27.13 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.9 
 
 		 783 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 991 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 815 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 856 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 681 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 3706 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.41 
 
 		 744 aa  124  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 215 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 924 aa  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 1654 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 1093 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 771 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 1093 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 1714 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 834 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 964 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 764 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 1227 aa  114  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 1239 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 1177 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 941 aa  113  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1210 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 572 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 1676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 613 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 872 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 1047 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.84 
 
 		 754 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 1051 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 732 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1253 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 878 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 913 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 439 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 636 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 1560 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 771 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 698 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.4 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 932 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 398 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  24.87 
 
 		 1248 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 674 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 472 aa  107  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 682 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 723 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 349 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 945 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 839 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 727 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 749 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>