More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7712 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 509 aa  1004    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  62.12 
 
 		 503 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  61.76 
 
 		 497 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  59.02 
 
 		 490 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  55.68 
 
 		 521 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  56.86 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  55.58 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  57.95 
 
 		 487 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 		 492 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  51.68 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  52.99 
 
 		 508 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  52.78 
 
 		 516 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  50.61 
 
 		 517 aa  450  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  52.28 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  50.1 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 500 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  52.78 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 512 aa  428  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 489 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  45.54 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  46.58 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  39.6 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 		 502 aa  303  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 492 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  22.65 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 526 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 613 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 3706 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.93 
 
 		 744 aa  115  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 636 aa  113  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 1093 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 1093 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 991 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  28.35 
 
 		 918 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.79 
 
 		 1239 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 1227 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.13 
 
 		 754 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 945 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 767 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 732 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 1676 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 834 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 1654 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 912 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 682 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 924 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.73 
 
 		 1248 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 647 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 878 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 839 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 945 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 585 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 936 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 334 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 2693 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  29.84 
 
 		 657 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 1253 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 909 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 1183 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 747 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 815 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 1051 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1210 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1182 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 932 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 674 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.33 
 
 		 783 aa  96.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.35 
 
 		 1668 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 408 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  25 
 
 		 676 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 1047 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 764 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 532 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 757 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>