More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6290 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  68.49 
 
 		 512 aa  688    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 492 aa  976    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  58.82 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  58.82 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  58.82 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  57.11 
 
 		 500 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  58.42 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  57.98 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  55.6 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  58.2 
 
 		 492 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  57.59 
 
 		 508 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  55.91 
 
 		 501 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  57.91 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  54.29 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  53.77 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  51.6 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  54.03 
 
 		 490 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  53.55 
 
 		 491 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  52.18 
 
 		 509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  52 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 521 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  53.96 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 514 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  50.1 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  48.58 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  48.69 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 484 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 492 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 489 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 490 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  35.7 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 475 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 480 aa  227  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 492 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  24.85 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37.98 
 
 		 744 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 1093 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 1093 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 1253 aa  120  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 991 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  28.8 
 
 		 918 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.43 
 
 		 754 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 3706 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.06 
 
 		 1248 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 1390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 215 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 1239 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1051 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 347 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 945 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 1047 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  29.46 
 
 		 657 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 1654 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1227 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.88 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 674 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 839 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 819 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 732 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 572 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1182 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 551 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 834 aa  107  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 681 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 1676 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 613 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 682 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 932 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.89 
 
 		 1668 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 771 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 526 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1560 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 334 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.02 
 
 		 895 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 875 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1210 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 924 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.02 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 874 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 941 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>