More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1411 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 500 aa  988    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  57.11 
 
 		 492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  56.06 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  50.8 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  51 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  50.8 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  50.8 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  52.26 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  50.8 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  53.05 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  50.89 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  51.53 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  50.3 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  47.98 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 		 490 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  47.14 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 		 521 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  47.08 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 509 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 484 aa  360  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 492 aa  359  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 500 aa  347  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 489 aa  309  8e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  36.2 
 
 		 494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 495 aa  273  5.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 502 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 475 aa  243  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 492 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  23.37 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 3706 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 613 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 2693 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.06 
 
 		 744 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 1253 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 732 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.78 
 
 		 754 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 1239 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 1676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 1654 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  32.05 
 
 		 657 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 215 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1210 aa  113  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 945 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 1051 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 839 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 815 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  30.04 
 
 		 918 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 532 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 1227 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 767 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 347 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 1093 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 294 aa  110  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 1093 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.9 
 
 		 676 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 991 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 1714 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 924 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.47 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  30.59 
 
 		 1248 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 788 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 1177 aa  107  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 1560 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1182 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 674 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 1390 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 936 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 1047 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 941 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 414 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 551 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 932 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 764 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 909 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 874 aa  103  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 1246 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 945 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.74 
 
 		 1668 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 886 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>