More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2070 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
358 aa  724    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
929 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
1191 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
725 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
713 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
409 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
713 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  30.88 
 
 
717 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  33.14 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
489 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  36.69 
 
 
872 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
503 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
528 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
488 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
907 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  34.07 
 
 
728 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
738 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
586 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
488 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
850 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  33.86 
 
 
488 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
840 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
507 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
588 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
728 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.05 
 
 
1190 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
304 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
387 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
571 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
733 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.05 
 
 
1027 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
481 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
344 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
662 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
759 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
491 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  30.83 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
498 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
346 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
571 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
336 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
336 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  31.14 
 
 
480 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
336 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  31.47 
 
 
463 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
1016 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
263 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
582 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
380 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
356 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  31.47 
 
 
463 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
601 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.98 
 
 
1167 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  37.05 
 
 
1041 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
465 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
633 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
488 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
512 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  30.62 
 
 
313 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
635 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
897 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  29.65 
 
 
624 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
639 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
1001 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  34.08 
 
 
856 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  29.05 
 
 
478 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.05 
 
 
1160 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
602 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
930 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
484 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
362 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  31.2 
 
 
703 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  34.52 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  28.34 
 
 
1092 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  28.67 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  31.58 
 
 
930 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33 
 
 
849 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
583 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  28.1 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
496 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
575 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  33.16 
 
 
1170 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
867 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  33.81 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  32.5 
 
 
842 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
677 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  33.16 
 
 
1170 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>