More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2128 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
1059 aa  2110    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  54.27 
 
 
1216 aa  1033    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  37.02 
 
 
952 aa  382  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  43.2 
 
 
991 aa  344  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  35.49 
 
 
1969 aa  328  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 
1589 aa  328  3e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
982 aa  311  5e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  39.5 
 
 
1154 aa  285  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  30.41 
 
 
1073 aa  280  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  34.01 
 
 
1081 aa  273  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.37 
 
 
700 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  28.96 
 
 
896 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.76 
 
 
712 aa  243  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.38 
 
 
728 aa  242  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  29.31 
 
 
750 aa  217  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33 
 
 
564 aa  210  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  27.53 
 
 
919 aa  205  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  34.73 
 
 
636 aa  201  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.54 
 
 
637 aa  184  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 
684 aa  180  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  32.42 
 
 
994 aa  174  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 
1071 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 
1260 aa  171  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  31.81 
 
 
680 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  32.7 
 
 
553 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  31.33 
 
 
524 aa  166  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  32.31 
 
 
537 aa  161  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 
532 aa  161  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  31.1 
 
 
677 aa  159  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 
781 aa  158  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
873 aa  144  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
1064 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  27.01 
 
 
843 aa  142  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
921 aa  141  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
951 aa  140  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
655 aa  139  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 
644 aa  134  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
639 aa  133  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
1300 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 
770 aa  131  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
838 aa  128  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
821 aa  125  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  28.26 
 
 
834 aa  124  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
817 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.15 
 
 
642 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  26.59 
 
 
666 aa  118  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  28.5 
 
 
737 aa  117  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.85 
 
 
598 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
786 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  28.13 
 
 
807 aa  111  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
632 aa  109  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
1195 aa  108  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
700 aa  107  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
1807 aa  102  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  27.91 
 
 
539 aa  102  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 
1390 aa  102  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
633 aa  101  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  37.23 
 
 
930 aa  101  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.8 
 
 
1054 aa  100  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
478 aa  100  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
1383 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.59 
 
 
861 aa  100  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
603 aa  100  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
896 aa  99.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
796 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
875 aa  98.6  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 
632 aa  98.6  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
890 aa  97.8  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  35.08 
 
 
865 aa  97.8  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  27.84 
 
 
767 aa  97.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.38 
 
 
242 aa  97.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.13 
 
 
947 aa  96.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
778 aa  96.3  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
1045 aa  95.9  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  33.49 
 
 
866 aa  94  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.99 
 
 
1094 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2725  diguanylate cyclase  27.27 
 
 
479 aa  92  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.443683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2710  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.43 
 
 
585 aa  92  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132036  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0071  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.29 
 
 
697 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
546 aa  89.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  42.98 
 
 
685 aa  89  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
1166 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 
906 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 
1415 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1126 aa  87  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1431 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
789 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  29.07 
 
 
440 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
1166 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.69 
 
 
1101 aa  85.5  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
621 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
1052 aa  85.1  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.12 
 
 
746 aa  85.1  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.32 
 
 
507 aa  84.7  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1274  PAS sensor protein  26.63 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
1267 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
779 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
529 aa  83.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
869 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
683 aa  82.8  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>