More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3076 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 616 aa  1242    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.58 
 
 		 617 aa  776    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 641 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 596 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 		 887 aa  281  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  28.76 
 
 		 738 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 741 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 970 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 785 aa  203  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 1039 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  41.47 
 
 		 998 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 977 aa  200  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  42.62 
 
 		 910 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 1034 aa  197  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 395 aa  197  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  34.08 
 
 		 823 aa  196  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 917 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 579 aa  193  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  26.32 
 
 		 588 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 577 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 631 aa  190  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 860 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 574 aa  186  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 		 791 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1003 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 		 927 aa  181  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1303 aa  180  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 858 aa  180  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  36.69 
 
 		 955 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  32.3 
 
 		 810 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 781 aa  179  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 590 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 569 aa  177  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  42.05 
 
 		 800 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1090 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1090 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 798 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1029 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1068 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 846 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  26.29 
 
 		 565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 975 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  41.59 
 
 		 792 aa  174  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 803 aa  174  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1022 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 1267 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 699 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 568 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 569 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 		 687 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 945 aa  170  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 1271 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 974 aa  170  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.15 
 
 		 1442 aa  170  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 1064 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 1046 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1322 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1287 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  35.14 
 
 		 794 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 841 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  39.85 
 
 		 1346 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 633 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  30.45 
 
 		 680 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  32.1 
 
 		 1323 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 593 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.61 
 
 		 882 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 562 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  40.81 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 1055 aa  166  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  31.7 
 
 		 1028 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 		 796 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 939 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 882 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 882 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  28.8 
 
 		 943 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1323 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 810 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1135 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 581 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 873 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 874 aa  164  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 912 aa  163  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 823 aa  163  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.18 
 
 		 1023 aa  163  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 813 aa  163  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1352 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1959 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.75 
 
 		 2213 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 984 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 759 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 770 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1313 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1166 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>