More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0962 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 823 aa  1649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 855 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0218  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 855 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.227193  normal  0.9118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 890 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1721  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 869 aa  340  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 888 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.408662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3048  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 850 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 881 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 674 aa  280  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 866 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 874 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  33.76 
 
 		 982 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1177 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  39.13 
 
 		 606 aa  258  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 896 aa  258  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 940 aa  257  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 767 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 947 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 823 aa  251  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  35.17 
 
 		 1193 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 827 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 785 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 780 aa  248  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 882 aa  247  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1049 aa  247  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 1433 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 781 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 973 aa  243  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1223 aa  243  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 957 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 791 aa  241  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35.77 
 
 		 882 aa  241  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 846 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1199 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1090 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1090 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  32.82 
 
 		 755 aa  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 1287 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  39.26 
 
 		 571 aa  237  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1116 aa  237  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  34.25 
 
 		 987 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1055 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 862 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 966 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1118 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 959 aa  234  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  32.2 
 
 		 1028 aa  234  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.82 
 
 		 645 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 969 aa  233  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  37.28 
 
 		 651 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  29.6 
 
 		 952 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 1226 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1691 aa  231  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1003 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 1313 aa  231  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 822 aa  231  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  34.39 
 
 		 985 aa  231  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  38.04 
 
 		 559 aa  231  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 765 aa  230  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 695 aa  230  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1007 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 1005 aa  229  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 717 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  37.72 
 
 		 729 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 932 aa  228  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  34.19 
 
 		 761 aa  227  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  32.84 
 
 		 984 aa  226  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 1002 aa  227  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  37.24 
 
 		 651 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  30.7 
 
 		 988 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1326 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  30.7 
 
 		 1032 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 643 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  30.7 
 
 		 1014 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 817 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 898 aa  226  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 1069 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 801 aa  226  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1029 aa  226  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  37.4 
 
 		 1001 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.88 
 
 		 763 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 969 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 		 647 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1124 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 803 aa  224  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  33.42 
 
 		 697 aa  224  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 1068 aa  224  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 627 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 647 aa  223  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 957 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1027 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 643 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1499 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 813 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1350 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 2109 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1058 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 643 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 968 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>