More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2547 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  100 
 
 		 395 aa  798    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0692  response regulator receiver domain-containing protein  34.79 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2727  response regulator receiver protein  32.45 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2371  response regulator receiver protein  32.75 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0784161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  27.97 
 
 		 476 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  27.48 
 
 		 481 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  27.48 
 
 		 481 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  26.98 
 
 		 484 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  27.48 
 
 		 481 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  27.48 
 
 		 481 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  27.48 
 
 		 481 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  27.48 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  27.23 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  26.98 
 
 		 518 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  28.37 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  27.16 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  27.16 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  26.98 
 
 		 475 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  27.16 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  27.16 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  26.98 
 
 		 475 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  27.03 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  27.23 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  27.4 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 		 358 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.43 
 
 		 449 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  26.65 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 346 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 538 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  28.08 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  26.9 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 		 324 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  25.94 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0430  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  44.62 
 
 		 823 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 345 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2721  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 188 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  41.96 
 
 		 187 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.81 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  26.52 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  39.29 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 1465 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1452  response regulator receiver protein  24.16 
 
 		 392 aa  99.4  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000159785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  44.62 
 
 		 189 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 270 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  43.09 
 
 		 492 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  38.17 
 
 		 563 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  28.9 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  25.9 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  23.81 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 746 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  40.17 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  41.03 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.42 
 
 		 1355 aa  94  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2950  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  35.07 
 
 		 557 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  27.11 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.92 
 
 		 515 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  32.88 
 
 		 553 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  40.6 
 
 		 185 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 311 aa  91.3  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0969  response regulator receiver  39.57 
 
 		 188 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  35.92 
 
 		 151 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 806 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  34.43 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 		 1180 aa  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.58 
 
 		 1172 aa  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.34 
 
 		 629 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.4 
 
 		 994 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2976  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 262 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  40.19 
 
 		 965 aa  88.6  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  32.09 
 
 		 557 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 293 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.66 
 
 		 317 aa  88.2  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3060  response regulator receiver  35.82 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  42.57 
 
 		 491 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 491 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2813  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>