More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0969 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0969  response regulator receiver  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2451  response regulator  34.22 
 
 		 171 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  41.96 
 
 		 439 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  41.96 
 
 		 481 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  41.96 
 
 		 481 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  41.96 
 
 		 481 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  41.96 
 
 		 481 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  41.96 
 
 		 481 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 		 469 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 		 469 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  41.26 
 
 		 484 aa  111  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  41.26 
 
 		 481 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.31 
 
 		 1355 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 439 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  40.97 
 
 		 451 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.35 
 
 		 473 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  41.96 
 
 		 475 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  40.56 
 
 		 476 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  41.96 
 
 		 456 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  41.26 
 
 		 475 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  41.26 
 
 		 475 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  41.26 
 
 		 518 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  41.26 
 
 		 475 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  41.26 
 
 		 475 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  41.26 
 
 		 475 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 456 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 		 270 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 452 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.74 
 
 		 472 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.74 
 
 		 472 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 		 470 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2721  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  42.28 
 
 		 447 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 823 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  34.88 
 
 		 438 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  40.44 
 
 		 441 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  38.24 
 
 		 965 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 		 358 aa  98.6  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  33.89 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 		 449 aa  97.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 538 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  39.69 
 
 		 262 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1570  response regulator receiver protein  35.91 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 806 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 		 479 aa  95.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  36.02 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 746 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 1465 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 375 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 		 444 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 375 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 185 aa  91.3  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 395 aa  90.5  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  39.85 
 
 		 304 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  39.52 
 
 		 303 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  30.81 
 
 		 434 aa  88.2  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 		 391 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 520 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.9 
 
 		 994 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3800  response regulator receiver domain-containing protein  31.05 
 
 		 488 aa  85.9  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  33.82 
 
 		 439 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.52 
 
 		 629 aa  85.1  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  31.21 
 
 		 563 aa  85.1  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  33.33 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2727  response regulator receiver protein  33.57 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.85 
 
 		 472 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3245  sigma 54-dependent DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 488 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  34.32 
 
 		 491 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4689  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 447 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5144  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 491 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1912  cyclic nucleotide-binding protein  39.1 
 
 		 590 aa  82  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0713503  normal  0.243299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2371  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 382 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0784161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  34.92 
 
 		 359 aa  81.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4048  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 459 aa  81.3  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650008  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.91 
 
 		 515 aa  81.3  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0605  response regulator  37.5 
 
 		 536 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01019  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  38.13 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  33.54 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06147  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  38.13 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 395 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1542  response regulator receiver domain-containing protein  33.58 
 
 		 309 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150385  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  36.43 
 
 		 431 aa  77.8  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 293 aa  77.8  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  34.59 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2539  response regulator  34.13 
 
 		 658 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1458  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.47036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4770  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0430  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1419  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.26 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1258  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  32.26 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0534594  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2288  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4576  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.32 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494559  normal  0.955166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2401  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 449 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>