More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1427 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  100 
 
 		 311 aa  633    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0720  response regulator receiver, fis type  36.72 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.935409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1766  response regulator receiver domain-containing protein  36.09 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2288  response regulator receiver domain-containing protein  36.69 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  38.38 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  37.68 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  44.53 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.52 
 
 		 994 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.45 
 
 		 1355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  36.88 
 
 		 823 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.85 
 
 		 629 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  42.64 
 
 		 438 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 		 472 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 		 472 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.76 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 154 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 439 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.41 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01019  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  43.8 
 
 		 549 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.159296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06147  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  43.8 
 
 		 549 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  43.44 
 
 		 965 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.44 
 
 		 473 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 		 469 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 		 469 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  41.54 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  40.8 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 491 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  41.13 
 
 		 491 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.14 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  44.74 
 
 		 434 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  41.38 
 
 		 481 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  41.38 
 
 		 481 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  41.38 
 
 		 481 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  41.38 
 
 		 481 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  41.38 
 
 		 481 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 484 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.48 
 
 		 452 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  38.21 
 
 		 1180 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1912  cyclic nucleotide-binding protein  40.16 
 
 		 590 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0713503  normal  0.243299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  39.84 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  41.96 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.24 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  40.52 
 
 		 481 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 262 aa  99.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  42.98 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 456 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  37.18 
 
 		 185 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  41.23 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3109  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 493 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.58 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.74 
 
 		 538 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  36.07 
 
 		 154 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  42.74 
 
 		 456 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 154 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  39.37 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2721  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 188 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5144  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 150 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 479 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  38.13 
 
 		 484 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3060  response regulator receiver  37.69 
 
 		 410 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  38.66 
 
 		 1156 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 363 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  45.76 
 
 		 622 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 641 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 		 622 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 		 622 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 		 1172 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.74 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  40.78 
 
 		 475 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  40.78 
 
 		 475 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  40.78 
 
 		 475 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  40.78 
 
 		 475 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  40.78 
 
 		 475 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 520 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 806 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1956  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 486 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.696783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  40.78 
 
 		 518 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2808  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 482 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2184  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 497 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.682977  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.11 
 
 		 515 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  34.17 
 
 		 151 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  33.79 
 
 		 553 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 485 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3245  sigma 54-dependent DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 488 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  37.4 
 
 		 746 aa  92.4  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  39.81 
 
 		 475 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 		 640 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  35 
 
 		 428 aa  92.4  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1542  response regulator receiver domain-containing protein  34.38 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150385  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2524  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 137 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 		 628 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  40.37 
 
 		 560 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  38.74 
 
 		 476 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1179  sigma-54 factor, interaction region  33.06 
 
 		 482 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0557788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0430  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 423 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>