More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2392 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
363 aa  739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 
365 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  42.94 
 
 
359 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
819 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
477 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3454  histidine kinase  32.5 
 
 
439 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
461 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  35.96 
 
 
444 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  48.97 
 
 
154 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2081  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
396 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  38.29 
 
 
737 aa  149  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  48.97 
 
 
154 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  45 
 
 
151 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  33.84 
 
 
655 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  32.9 
 
 
651 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  42.76 
 
 
154 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  31.4 
 
 
584 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  28.21 
 
 
544 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
395 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1341  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
495 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0234409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2524  response regulator receiver protein  40.94 
 
 
137 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
1003 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
650 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  32.33 
 
 
379 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  33.74 
 
 
656 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2103  histidine kinase  31.3 
 
 
382 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0386  two component sensor kinase  32.7 
 
 
495 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
775 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
883 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
729 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
725 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
887 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2260  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
361 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
767 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
775 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.99 
 
 
932 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
809 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0830  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00410023  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
406 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
631 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
504 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
639 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
792 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
1043 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  32.27 
 
 
932 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.81 
 
 
927 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
389 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
389 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
713 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0150  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
494 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
396 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
770 aa  112  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
1144 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
579 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
510 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
1383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1783  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
494 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.992798  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3153  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
664 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
632 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  28.99 
 
 
374 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
510 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  31.09 
 
 
952 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
490 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  32.35 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  29.27 
 
 
1346 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
579 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
404 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  29.83 
 
 
646 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
407 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
828 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
1807 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
417 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
361 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
450 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  27.31 
 
 
957 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.32 
 
 
317 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 
918 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  31.18 
 
 
793 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.37 
 
 
921 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
670 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 
375 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  30.4 
 
 
683 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.25 
 
 
918 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
396 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.25 
 
 
918 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>