More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0675 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  100 
 
 
646 aa  1324    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  51.47 
 
 
656 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  28.99 
 
 
655 aa  241  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
650 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  26.54 
 
 
651 aa  201  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 
680 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2081  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  32.75 
 
 
584 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.5 
 
 
708 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.07 
 
 
1045 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  23.95 
 
 
631 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
819 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3548  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
461 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  21.76 
 
 
914 aa  110  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
363 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  30.23 
 
 
359 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
737 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  30.65 
 
 
444 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  22.26 
 
 
696 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  23.58 
 
 
707 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3454  histidine kinase  31.6 
 
 
439 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.52 
 
 
642 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  24.4 
 
 
696 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.08 
 
 
663 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  27.64 
 
 
842 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  23.23 
 
 
600 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.58 
 
 
914 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
477 aa  98.2  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
513 aa  97.1  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  22.41 
 
 
918 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  22.13 
 
 
918 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  32.83 
 
 
389 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  21.04 
 
 
668 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  22.09 
 
 
1042 aa  94  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
958 aa  94.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.3 
 
 
634 aa  94.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
887 aa  94  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  21.37 
 
 
677 aa  94  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
721 aa  94  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
531 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
480 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
854 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  28.79 
 
 
354 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0103  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
379 aa  92.8  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689061  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
497 aa  92  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.93 
 
 
726 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
809 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  29.2 
 
 
776 aa  90.9  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  27.54 
 
 
470 aa  90.5  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
695 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  27.35 
 
 
632 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  27.87 
 
 
400 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
365 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
632 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 
710 aa  89.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.73 
 
 
1301 aa  89  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0588  Signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
326 aa  88.2  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
527 aa  87.8  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
632 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  31.9 
 
 
952 aa  87.8  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  32.33 
 
 
322 aa  87.4  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  22.84 
 
 
724 aa  87.4  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  24.2 
 
 
449 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  26.22 
 
 
629 aa  87.4  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
592 aa  87.4  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  31.22 
 
 
341 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  27.55 
 
 
464 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  21.3 
 
 
782 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
662 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
779 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  26.84 
 
 
477 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.49 
 
 
662 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.86 
 
 
662 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  27.55 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0907  sensor histidine kinase  27.55 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 
508 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
786 aa  86.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
775 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1741  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
857 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.99373 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1772  Signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.0899176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  26.7 
 
 
498 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
352 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
691 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.32 
 
 
509 aa  85.5  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
627 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
793 aa  85.5  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.36 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 
750 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3631  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.991332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
1807 aa  84.3  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  28.25 
 
 
539 aa  84  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  27.03 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  23.09 
 
 
715 aa  84.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>