More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1548 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 430 aa  884    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 854 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 1033 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 591 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0806  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 865 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.613384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  32 
 
 		 1053 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 887 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  36.51 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 651 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  37.92 
 
 		 582 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 901 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.67 
 
 		 591 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 547 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 627 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0696  sensory box/GGDEF family protein  67.21 
 
 		 568 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.612215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0539  sensory box, GGDEF family protein  67.21 
 
 		 567 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0539  sensory box, GGDEF family protein  67.21 
 
 		 567 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 632 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0683  sensory box/GGDEF family protein  67.21 
 
 		 567 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00619208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0757  sensory box/GGDEF family protein  67.21 
 
 		 567 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4673  sensory box/GGDEF family protein  67.21 
 
 		 567 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.6834899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 517 aa  183  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1114  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  58.16 
 
 		 722 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0541  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  66.39 
 
 		 567 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0664  sensory box/GGDEF family protein  66.39 
 
 		 567 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0595  sensory box/GGDEF family protein  66.39 
 
 		 567 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0628  sensory box/GGDEF family protein  66.39 
 
 		 567 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 368 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 618 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 632 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  33.17 
 
 		 632 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 444 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 697 aa  176  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  50.32 
 
 		 967 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  50.32 
 
 		 967 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 510 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 960 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1101 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  38.01 
 
 		 538 aa  171  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 539 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.0899176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 532 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1053 aa  170  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.69 
 
 		 916 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 929 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  32.51 
 
 		 842 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 884 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 761 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  33.95 
 
 		 537 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 1287 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.06 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.34 
 
 		 1303 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  46.26 
 
 		 817 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  46.26 
 
 		 817 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.32 
 
 		 1480 aa  163  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1313 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 384 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 841 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 506 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 1029 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 575 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 712 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  54.76 
 
 		 1177 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 1118 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 704 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.91 
 
 		 1245 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 656 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 951 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 1202 aa  156  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 642 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 1166 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 1064 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 640 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 927 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5134  histidine kinase  27.97 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1355  two component sensor histidine kinase  30.83 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.649509  normal  0.244031 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 683 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  31.06 
 
 		 727 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 1028 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 502 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 1669 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 626 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 643 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 791 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2870  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 510 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267269  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 926 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 821 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 729 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 781 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 		 894 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>