More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1632 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
513 aa  1033    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03102  two-component sensor kinase transcription regulator protein  38.59 
 
 
551 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
558 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5449  histidine kinase  34.06 
 
 
542 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0991  sensor histidine kinase  28.17 
 
 
549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000699146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
476 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
620 aa  145  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
723 aa  144  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
465 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
613 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
614 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
937 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
452 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
815 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.43 
 
 
503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  29.62 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.78 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5994  histidine kinase  32.8 
 
 
526 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0285375  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
639 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
537 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
524 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.53 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  29.34 
 
 
494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
641 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
389 aa  130  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
614 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
526 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.770795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
909 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
639 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0448  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
536 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
515 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
519 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
977 aa  126  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  31.41 
 
 
471 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
463 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
457 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
464 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  32.62 
 
 
587 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  29.63 
 
 
471 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  32.62 
 
 
587 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
1171 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
462 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.38 
 
 
463 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
469 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  25.83 
 
 
397 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
590 aa  124  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.19 
 
 
587 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.19 
 
 
587 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  27.04 
 
 
389 aa  123  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
587 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
457 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
889 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.53 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  31.62 
 
 
587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  30.77 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
709 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  31.27 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  31.22 
 
 
416 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  31.22 
 
 
416 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
607 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  33.33 
 
 
586 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  29.71 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
377 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  31.22 
 
 
416 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.46 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  31.22 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
597 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  28.45 
 
 
468 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
475 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  29.86 
 
 
392 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3510  ATPase domain-containing protein  33.23 
 
 
932 aa  120  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
469 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
640 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
463 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
384 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
628 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  29.86 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
609 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 
1133 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
564 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  35.96 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>