More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3510 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3817  Hpt sensor hybrid histidine kinase  97.03 
 
 
909 aa  1536    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2086  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.18 
 
 
909 aa  782    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  82.18 
 
 
920 aa  1330    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3510  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
932 aa  1803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.74 
 
 
891 aa  800    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
921 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.15 
 
 
923 aa  346  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
909 aa  342  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.16 
 
 
1014 aa  340  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
977 aa  330  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  31.9 
 
 
833 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
1202 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
816 aa  312  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
929 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1765 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
916 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.04 
 
 
1177 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1005 aa  308  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1326 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  36.55 
 
 
750 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1245 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 
1765 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
985 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
1165 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  36.34 
 
 
917 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.65 
 
 
929 aa  304  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
1768 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1310 aa  303  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
993 aa  302  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.82 
 
 
917 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
922 aa  301  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  30.31 
 
 
910 aa  300  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1767 aa  300  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  36.25 
 
 
925 aa  300  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
1258 aa  300  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.7 
 
 
1331 aa  299  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
919 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.46 
 
 
925 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  36.14 
 
 
727 aa  299  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
1284 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.59 
 
 
906 aa  298  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.48 
 
 
937 aa  298  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1767 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
990 aa  298  4e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1767 aa  297  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
1260 aa  296  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
946 aa  295  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
917 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1782 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  32.19 
 
 
2035 aa  294  6e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.35 
 
 
2213 aa  294  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.41 
 
 
932 aa  293  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
1786 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.76 
 
 
937 aa  293  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
1266 aa  293  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
1771 aa  293  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  31.39 
 
 
1574 aa  293  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.76 
 
 
1135 aa  292  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  30.07 
 
 
910 aa  292  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
917 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1784 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
917 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.46 
 
 
928 aa  291  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.37 
 
 
1763 aa  291  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.68 
 
 
933 aa  291  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
1398 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  30.73 
 
 
932 aa  291  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.17 
 
 
935 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.69 
 
 
918 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
967 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.69 
 
 
918 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.69 
 
 
918 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.69 
 
 
918 aa  289  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
964 aa  289  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.69 
 
 
918 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.75 
 
 
929 aa  288  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  33.86 
 
 
1021 aa  288  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  35.68 
 
 
905 aa  288  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
1340 aa  288  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.59 
 
 
941 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.7 
 
 
636 aa  287  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  31.9 
 
 
1689 aa  286  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.15 
 
 
918 aa  286  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.42 
 
 
935 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.47 
 
 
935 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.47 
 
 
933 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
981 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.87 
 
 
931 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.98 
 
 
918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.98 
 
 
918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.98 
 
 
918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.98 
 
 
918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.98 
 
 
918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.98 
 
 
918 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 
758 aa  284  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.47 
 
 
927 aa  284  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.89 
 
 
1001 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.22 
 
 
1109 aa  283  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.53 
 
 
948 aa  283  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>