More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0991 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0991  sensor histidine kinase  100 
 
 		 549 aa  1106    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000699146  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5449  histidine kinase  32.52 
 
 		 542 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 558 aa  248  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_003296  RS03102  two-component sensor kinase transcription regulator protein  31.99 
 
 		 551 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 513 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5994  histidine kinase  31.08 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0285375  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  30.86 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.770795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 438 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 639 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 937 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.27335  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  24.86 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  24.78 
 
 		 310 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  25 
 
 		 397 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 639 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  31.47 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 359 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 977 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 466 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  28.69 
 
 		 582 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 477 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  26.01 
 
 		 503 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 493 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 419 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  21.14 
 
 		 497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.35 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.15 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  32.52 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  27.15 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  31.95 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  25.55 
 
 		 484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 556 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1045  histidine kinase  29.15 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 641 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 		 770 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 477 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  27.49 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  27.35 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  25.45 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 614 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  26.34 
 
 		 925 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 489 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  27.99 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 460 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2157  histidine kinase  30.12 
 
 		 545 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 730 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.25 
 
 		 917 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1822  ATPase domain-containing protein  30.12 
 
 		 545 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  25.74 
 
 		 925 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 467 aa  108  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  32.11 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  26.13 
 
 		 663 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2709  histidine kinase  24.95 
 
 		 855 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  26.14 
 
 		 466 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.25 
 
 		 919 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 460 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  26.14 
 
 		 466 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 425 aa  107  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 608 aa  107  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.22 
 
 		 466 aa  107  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 459 aa  107  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 463 aa  107  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  29.78 
 
 		 471 aa  107  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 475 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 466 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  23.97 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  25.94 
 
 		 917 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>