More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2319 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  90.72 
 
 
539 aa  920    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.0899176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.61 
 
 
547 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
536 aa  1067    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  51.49 
 
 
582 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  51.31 
 
 
591 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  47.57 
 
 
563 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
854 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
430 aa  176  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
651 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  34.56 
 
 
537 aa  166  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
444 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  38.01 
 
 
1053 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
887 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  33.87 
 
 
583 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
751 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
632 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  35.62 
 
 
796 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
355 aa  153  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  38.61 
 
 
632 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  33.23 
 
 
524 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
632 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
604 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
1267 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
458 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
627 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
483 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
556 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
520 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
738 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
521 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
504 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0806  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
865 aa  144  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.613384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
683 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
517 aa  143  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
506 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
479 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
1177 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
1224 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
499 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
704 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
761 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
756 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  36.29 
 
 
749 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
929 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  31.5 
 
 
498 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
368 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
502 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
618 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
930 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  32.48 
 
 
496 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
1669 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
656 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  34.17 
 
 
499 aa  136  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
751 aa  136  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  29.53 
 
 
520 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  32.4 
 
 
533 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
799 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
915 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
775 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
572 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
798 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
591 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
712 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  35.56 
 
 
755 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
463 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  32.19 
 
 
767 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
499 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
431 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  33.33 
 
 
526 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
748 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  32.48 
 
 
505 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
1354 aa  133  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
604 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  33.22 
 
 
733 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  36.33 
 
 
794 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
639 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  34.89 
 
 
558 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
751 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  30.66 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
718 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
366 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
749 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
632 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  32.27 
 
 
492 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
575 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
904 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  28.95 
 
 
523 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  34.21 
 
 
762 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
829 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>