164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5597 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  57.14 
 
 		 642 aa  795    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  100 
 
 		 634 aa  1323    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  46.2 
 
 		 600 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1654  chromosome segregation ATPase; intracellular signalling protein  31.72 
 
 		 596 aa  306  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2267  hypothetical protein  26.47 
 
 		 590 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.22249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3338  hypothetical protein  26.15 
 
 		 641 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0108944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 650 aa  197  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 802 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.57 
 
 		 726 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  28.94 
 
 		 651 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  27.03 
 
 		 668 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 782 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  26.6 
 
 		 795 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  29.21 
 
 		 677 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  26.41 
 
 		 614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 662 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 662 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 662 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  30.72 
 
 		 715 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 663 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  30.9 
 
 		 707 aa  160  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  26.37 
 
 		 631 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  27.83 
 
 		 612 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  28.47 
 
 		 611 aa  154  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  28.6 
 
 		 716 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 644 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  26.04 
 
 		 588 aa  147  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  28.19 
 
 		 696 aa  144  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  25 
 
 		 627 aa  144  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 603 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  25.96 
 
 		 638 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.95 
 
 		 867 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  24.52 
 
 		 629 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.47 
 
 		 749 aa  134  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  27.54 
 
 		 708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  28.54 
 
 		 724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  25.06 
 
 		 630 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  24.27 
 
 		 565 aa  122  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.87 
 
 		 914 aa  118  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  24.35 
 
 		 918 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  22.54 
 
 		 673 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  22.74 
 
 		 631 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  26.78 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  23.97 
 
 		 564 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  24.48 
 
 		 918 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  23.08 
 
 		 601 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.23 
 
 		 660 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 680 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  23.09 
 
 		 636 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  26.04 
 
 		 625 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 624 aa  100  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  21.68 
 
 		 636 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  22.75 
 
 		 646 aa  94.7  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.37 
 
 		 686 aa  94  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  25.13 
 
 		 621 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0411  diguanylate cyclase  25.45 
 
 		 628 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  25.26 
 
 		 625 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0437  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  25.13 
 
 		 628 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0211155 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  25.39 
 
 		 625 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  25.38 
 
 		 628 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  23.76 
 
 		 624 aa  91.3  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  21.38 
 
 		 696 aa  90.9  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  23.09 
 
 		 1042 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3414  diverse 7TM receptor, extracellular region 2  21 
 
 		 560 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  24.35 
 
 		 625 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  25.2 
 
 		 641 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  21.24 
 
 		 621 aa  88.2  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  23.75 
 
 		 578 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  24.16 
 
 		 656 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  22.38 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  24.81 
 
 		 631 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  22.34 
 
 		 634 aa  85.1  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.14 
 
 		 1045 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  23.44 
 
 		 622 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.94 
 
 		 1182 aa  83.2  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3756  diguanylate cyclase  21.06 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  21.68 
 
 		 629 aa  82  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.23 
 
 		 853 aa  81.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  25.49 
 
 		 641 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00565  Signaling protein with a acyltransferase and GGDEF domains  21.77 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1061  diguanylate cyclase  22.01 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  21.53 
 
 		 655 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  21.32 
 
 		 914 aa  77.8  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  23.56 
 
 		 566 aa  76.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3230  hypothetical protein  28.35 
 
 		 356 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  21.68 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1543  hypothetical protein  28.35 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3177  hypothetical protein  28.35 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0357941  normal  0.042708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3779  hypothetical protein  28.35 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5775  hypothetical protein  28.35 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  22.37 
 
 		 696 aa  70.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5545  hypothetical protein  27.56 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.040244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5066  hypothetical protein  27.56 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  22.79 
 
 		 925 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2507  hypothetical protein  27.56 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2538  GGDEF domain-containing protein  20.41 
 
 		 648 aa  67  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000110944  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3037  7TM domain sensor diguanylate cyclase  20.74 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  24.54 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2693  diguanylate cyclase  24.23 
 
 		 570 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>