More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1562 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
680 aa  1354    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  28.46 
 
 
696 aa  227  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
686 aa  207  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1256  histidine kinase  29.56 
 
 
652 aa  184  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
662 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
662 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  30.09 
 
 
698 aa  177  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
663 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  28.98 
 
 
668 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
662 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  29.82 
 
 
689 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 
802 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  24.35 
 
 
646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  28.74 
 
 
795 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  29.05 
 
 
677 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  24.34 
 
 
726 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.73 
 
 
708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3414  diverse 7TM receptor, extracellular region 2  27.38 
 
 
560 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
644 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 
782 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
682 aa  139  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  20.36 
 
 
715 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  26.54 
 
 
588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  21.7 
 
 
656 aa  134  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  32.57 
 
 
636 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  33.47 
 
 
586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
511 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 
686 aa  126  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  26.61 
 
 
914 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  21.76 
 
 
651 aa  126  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  29.93 
 
 
629 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
564 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
535 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
535 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
489 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  37.39 
 
 
535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  24.74 
 
 
1042 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  29.23 
 
 
673 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  21.53 
 
 
724 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  27.09 
 
 
614 aa  120  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
463 aa  120  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  27.11 
 
 
636 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.36 
 
 
469 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
523 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  32.95 
 
 
927 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  25.14 
 
 
612 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
444 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
469 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  32.82 
 
 
449 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.48 
 
 
642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
815 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  27.08 
 
 
918 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  26.55 
 
 
630 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41190  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  26.92 
 
 
796 aa  114  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  32.7 
 
 
469 aa  114  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0377  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 
673 aa  114  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882794  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  38.28 
 
 
857 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
467 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1098  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.13 
 
 
633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0013981  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1632  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00192996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  21.84 
 
 
650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
708 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
384 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  25.4 
 
 
945 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
581 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  21.75 
 
 
716 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
602 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  22.05 
 
 
696 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
474 aa  111  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  24.72 
 
 
634 aa  111  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
418 aa  110  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
816 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
440 aa  110  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770114  normal  0.0682778 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
412 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.54 
 
 
1045 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
694 aa  110  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149051  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  34.38 
 
 
470 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
466 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  21.99 
 
 
707 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
587 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  26.99 
 
 
918 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
541 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
421 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
612 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
436 aa  108  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  36.13 
 
 
629 aa  108  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 
1341 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
528 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  33.72 
 
 
529 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  35.5 
 
 
364 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  35.5 
 
 
364 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
412 aa  107  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.05 
 
 
1162 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
366 aa  107  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
679 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  30 
 
 
919 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>