More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1222 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 650 aa  1326    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 651 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  27.55 
 
 		 655 aa  243  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 656 aa  213  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.1 
 
 		 600 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  28.89 
 
 		 646 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.97 
 
 		 634 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.03 
 
 		 642 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  31.08 
 
 		 631 aa  180  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2267  hypothetical protein  30.12 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.22249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1654  chromosome segregation ATPase; intracellular signalling protein  27.24 
 
 		 596 aa  161  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 		 663 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  22.14 
 
 		 795 aa  150  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  23.47 
 
 		 715 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  24.89 
 
 		 726 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  22.69 
 
 		 677 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  22.14 
 
 		 668 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 		 662 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3338  hypothetical protein  28.16 
 
 		 641 aa  143  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0108944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.57 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  20.97 
 
 		 802 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  21.53 
 
 		 782 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 461 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.03 
 
 		 660 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.84 
 
 		 914 aa  127  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  32.6 
 
 		 584 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  25.86 
 
 		 588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 349 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 696 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 365 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 444 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  22.26 
 
 		 918 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3454  histidine kinase  29.43 
 
 		 439 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 737 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2081  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.41 
 
 		 708 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 809 aa  111  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  23.93 
 
 		 614 aa  110  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  22.89 
 
 		 627 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 819 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.12 
 
 		 867 aa  107  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  24.65 
 
 		 716 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  32.89 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  25 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  22.71 
 
 		 707 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  24.14 
 
 		 603 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41190  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  19.97 
 
 		 796 aa  104  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  22.42 
 
 		 1042 aa  104  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  22.43 
 
 		 666 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 721 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 1043 aa  101  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.91 
 
 		 680 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 452 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  23.82 
 
 		 696 aa  99.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.42 
 
 		 686 aa  99  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 387 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2103  histidine kinase  26.46 
 
 		 382 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  25.07 
 
 		 631 aa  97.8  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  23.14 
 
 		 630 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 421 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  27.31 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 541 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  27.31 
 
 		 354 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  25 
 
 		 634 aa  95.5  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  21.01 
 
 		 636 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 421 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.86 
 
 		 532 aa  94.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  23.53 
 
 		 730 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  23.79 
 
 		 601 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  27.61 
 
 		 498 aa  94  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 628 aa  93.6  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 470 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 477 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  21.68 
 
 		 724 aa  92.8  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  26.41 
 
 		 499 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  24.68 
 
 		 611 aa  92  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 419 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 420 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  24.05 
 
 		 564 aa  91.3  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.76 
 
 		 749 aa  90.9  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  21.55 
 
 		 638 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  24.68 
 
 		 458 aa  90.9  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.64 
 
 		 1045 aa  90.5  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 776 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 761 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 770 aa  90.1  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  25.8 
 
 		 583 aa  89.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  29.26 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.92 
 
 		 458 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 941 aa  89.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 799 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 711 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 377 aa  88.6  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 515 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 352 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  25.25 
 
 		 458 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  25.87 
 
 		 539 aa  88.2  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>