More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2081 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2081  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
396 aa  811    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
819 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  37.08 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
461 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
737 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
363 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  28.84 
 
 
359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3454  histidine kinase  32.43 
 
 
439 aa  146  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  32 
 
 
656 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1269  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
416 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.906191  normal  0.151074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  29.87 
 
 
646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  28.17 
 
 
500 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
651 aa  126  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  24.94 
 
 
575 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  30.68 
 
 
655 aa  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  25.66 
 
 
575 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4152  histidine kinase  27.75 
 
 
662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  29.26 
 
 
584 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
650 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3001  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
386 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 
1003 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
489 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
1010 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
363 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  25.42 
 
 
588 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
352 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
387 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 
404 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0264  Signal transduction histidine kinase-like  26.92 
 
 
666 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
443 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
587 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
761 aa  103  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
383 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.55 
 
 
897 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000208588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 
389 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 
389 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  26.15 
 
 
563 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 
446 aa  99.4  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
733 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
941 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.26 
 
 
1152 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 
649 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  30.13 
 
 
952 aa  97.4  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  30.94 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 
1048 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 
1013 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  27.8 
 
 
812 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  33.56 
 
 
568 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
785 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1758  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  34.67 
 
 
700 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  26.57 
 
 
582 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
677 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3153  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
366 aa  96.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
532 aa  96.7  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3548  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
486 aa  96.3  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0103  sensor histidine kinase  25.47 
 
 
379 aa  96.3  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689061  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  26.13 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  28.79 
 
 
842 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  26.22 
 
 
591 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
462 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
385 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  29.63 
 
 
683 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  25.25 
 
 
587 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 
809 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
713 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
536 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
662 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0054  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
401 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  25.96 
 
 
723 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  25.96 
 
 
723 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  25.96 
 
 
723 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  25.96 
 
 
723 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
620 aa  93.2  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  25.96 
 
 
821 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
394 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  25.96 
 
 
821 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 
374 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
396 aa  92.8  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
384 aa  92.8  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  25.96 
 
 
821 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0553  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  27.82 
 
 
268 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  29.35 
 
 
637 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
576 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
527 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>