More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0553 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0553  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
440 aa  882    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
527 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
960 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
527 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
527 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 
529 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
529 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 
515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
642 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5844  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  44.02 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.59 
 
 
408 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 
566 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  43.08 
 
 
552 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.51 
 
 
817 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 
361 aa  200  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
838 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
1195 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 
729 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.35 
 
 
821 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
683 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 
767 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
786 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
951 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
674 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
883 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
1532 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
532 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
792 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
501 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0402  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
398 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.93747  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 
639 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
789 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
368 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  44.09 
 
 
528 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 
1267 aa  193  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  46.91 
 
 
494 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 
556 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
793 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
385 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
415 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.653943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  46.74 
 
 
723 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  46.74 
 
 
723 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  46.74 
 
 
723 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  46.74 
 
 
723 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  46.74 
 
 
821 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  46.74 
 
 
821 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 
640 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  42.35 
 
 
378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 
681 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  46.74 
 
 
821 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0131  response regulator receiver (CheY) and unknown domain-containing protein  52.97 
 
 
337 aa  190  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
769 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
535 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3356  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
401 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
765 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
543 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2247  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  62 
 
 
518 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.77168  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
502 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
450 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 
810 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 
412 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  45.85 
 
 
564 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
628 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
1064 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  44.31 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 
575 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1908  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  52.58 
 
 
519 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  46.28 
 
 
812 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
626 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0491  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  55.62 
 
 
522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.165576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2561  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.03 
 
 
517 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00356747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
1359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
664 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
525 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
769 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02571  response regulator  52.22 
 
 
521 aa  180  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
1140 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
391 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
380 aa  180  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1789  response regulator receiver protein  49.47 
 
 
524 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101023  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  38.49 
 
 
505 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1853  metal-dependent phosphohydrolase  49.74 
 
 
527 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0219327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0215  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.91 
 
 
536 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
698 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
761 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
551 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 
810 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3114  metal dependent phosphohydrolase  53.85 
 
 
523 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00390297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
435 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
1669 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
781 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
1252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2222  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.95 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.151758  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  37.23 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
929 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2212  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.95 
 
 
523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.16257  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2172  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.95 
 
 
523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0465103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>