More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2727 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
576 aa  1170    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
1383 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
704 aa  251  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
632 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
712 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
632 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.32 
 
 
960 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  49.41 
 
 
727 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
488 aa  216  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
647 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
416 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
647 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 
499 aa  207  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
1559 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
713 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
705 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
607 aa  195  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
607 aa  195  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
607 aa  195  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
632 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
761 aa  193  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
1406 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  33.96 
 
 
632 aa  181  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
632 aa  181  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
1064 aa  181  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.44 
 
 
1535 aa  180  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
604 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
627 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
930 aa  177  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5027  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
887 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
683 aa  173  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
1297 aa  173  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
708 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
1177 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
835 aa  171  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  28.17 
 
 
1303 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
896 aa  170  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5224  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
374 aa  170  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
1253 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
960 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
809 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
807 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 
705 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.41 
 
 
527 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  27.2 
 
 
1020 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.23 
 
 
1927 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
1068 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1223 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.37 
 
 
1465 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.24 
 
 
1113 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  30.69 
 
 
498 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
798 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
922 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.61 
 
 
1499 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
640 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
1108 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
696 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
1002 aa  154  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
1562 aa  154  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2975  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.62 
 
 
1084 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
883 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
626 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
1015 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 
1267 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
881 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  30.13 
 
 
1053 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  58.72 
 
 
1177 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
520 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  47.55 
 
 
1714 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
678 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
929 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
789 aa  148  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
501 aa  148  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
1140 aa  148  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
1043 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
1532 aa  147  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
793 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
816 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  32.54 
 
 
616 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
761 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  50.38 
 
 
1346 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
430 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 
938 aa  144  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
618 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  25.58 
 
 
931 aa  143  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
506 aa  143  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
680 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  45.77 
 
 
1335 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  51.61 
 
 
1251 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
559 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
817 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
767 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
515 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
678 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>