More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3548 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3548  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 486 aa  995    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 368 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  32.7 
 
 		 656 aa  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3001  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 499 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 952 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 761 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 632 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 819 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 704 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  36.03 
 
 		 444 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5224  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 896 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 556 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 643 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  33.85 
 
 		 646 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 821 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  33.06 
 
 		 1020 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 538 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 407 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 683 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 713 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 618 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 717 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 831 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 809 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.88 
 
 		 1169 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 922 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 717 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 1267 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 880 aa  107  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 719 aa  106  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  31.89 
 
 		 379 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 799 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 710 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 786 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  29.2 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  30.07 
 
 		 528 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 774 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 792 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 798 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 960 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 717 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3795  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 665 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 717 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5027  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 717 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 960 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 651 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  28.57 
 
 		 727 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 717 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 576 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  29.61 
 
 		 1169 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 973 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  28.47 
 
 		 564 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2103  histidine kinase  30.74 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 604 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 929 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11588  two-component sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 403 aa  103  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 583 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3605  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.6 
 
 		 873 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 757 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 767 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  31.37 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  29.02 
 
 		 729 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5844  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  28.57 
 
 		 529 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 655 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 1144 aa  101  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 761 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 639 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 717 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  32.45 
 
 		 1093 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 817 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 520 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1028 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 626 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 662 aa  100  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 461 aa  99.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 515 aa  99.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  30.19 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  29.85 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 1383 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 729 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  31.69 
 
 		 717 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  27.63 
 
 		 378 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>