More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0692 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0692  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  781    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  34.79 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2371  response regulator receiver protein  34.64 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0784161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2727  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 473 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  29.06 
 
 		 484 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 469 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 469 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  28.09 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  28.09 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  28.09 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  28.09 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  28.09 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  28.09 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  27.85 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.99 
 
 		 470 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.68 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  27.83 
 
 		 438 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  29.36 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  29.36 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  29.36 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  29.36 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  29.36 
 
 		 518 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  29.36 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  30 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  26.9 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.86 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0430  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  27.51 
 
 		 476 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 346 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2367  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 538 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  41.78 
 
 		 185 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  25.68 
 
 		 451 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2721  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 188 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  26.22 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 324 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  28.86 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  24.1 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.77 
 
 		 479 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  26.37 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  37.96 
 
 		 965 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 262 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0862  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.747276  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 		 560 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  38.93 
 
 		 270 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  36.18 
 
 		 189 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  36.64 
 
 		 823 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.23 
 
 		 1355 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  23.34 
 
 		 441 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1452  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000159785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 495 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0534594  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 154 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  34.85 
 
 		 557 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  36.36 
 
 		 557 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  34.31 
 
 		 553 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  34.9 
 
 		 746 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.6 
 
 		 994 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  38.28 
 
 		 311 aa  90.5  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1542  response regulator receiver domain-containing protein  38.28 
 
 		 309 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150385  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  26.28 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  36.76 
 
 		 151 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1956  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 486 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.696783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  40.16 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  42.99 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 1465 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0063  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.56416e-22 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  35.34 
 
 		 154 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1891  response regulator  26.01 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.750204  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1570  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 210 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  33.08 
 
 		 312 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2808  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 482 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  36.97 
 
 		 359 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 806 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1357  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 144 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1179  sigma-54 factor, interaction region  38.02 
 
 		 482 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0557788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 484 aa  86.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  39.17 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3962  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  37.59 
 
 		 187 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  24.92 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0080  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  38.02 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.02 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3805  response regulator receiver domain-containing protein  25.06 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>