More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0648 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0648  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0471753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 619 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  36.67 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 225 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 235 aa  84.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 232 aa  84.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  34.45 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 508 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2657  response regulator receiver  35.54 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  0.494085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  35 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 918 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  32.2 
 
 		 253 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0533  histidine kinase  38.46 
 
 		 244 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 240 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.17 
 
 		 234 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  35.83 
 
 		 234 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 236 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 245 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 230 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 222 aa  80.1  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 302 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 232 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 508 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  33.88 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  34.17 
 
 		 1340 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1343  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 782 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 369 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 393 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  33.64 
 
 		 516 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 234 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  39.32 
 
 		 1343 aa  77.4  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 509 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 238 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  32.52 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 227 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 227 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 237 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 227 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 283 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 436 aa  77  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 233 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.76 
 
 		 236 aa  77.4  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  36.97 
 
 		 239 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 232 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  33.05 
 
 		 237 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 511 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.09 
 
 		 317 aa  77  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36.97 
 
 		 234 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 233 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  33.33 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  33.33 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  33.33 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  36.75 
 
 		 998 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  34.75 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>