More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1376 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  77.78 
 
 		 227 aa  349  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  47.77 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  41.59 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.73 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.3 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  41.44 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  40.35 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.6 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  37.95 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  39.46 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  39.21 
 
 		 241 aa  165  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.56 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  35.59 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.68 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.68 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  38.33 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  35.14 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  38.81 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  38.33 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  39.01 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.64 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  38.39 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.99 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.59 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  42.47 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.59 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  37.89 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  37.33 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  37.33 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  38.81 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.15 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  37.33 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  36.24 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  37.05 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.56 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  38.86 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.06 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  38.6 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  36.84 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  36.99 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  38.74 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  40.91 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  36.44 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  38.22 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.18 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  39.21 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  36.07 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  36.07 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.36 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  36.07 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  36.07 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.36 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.36 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.36 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.36 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.64 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.6 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  39.13 
 
 		 243 aa  147  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  34.21 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  34.21 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.21 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.21 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  34.21 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.21 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.21 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.21 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1257  response regulator receiver  36 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  32.29 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  37.13 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  32.29 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  32.29 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.55 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  34.82 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.29 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  38.67 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  39.13 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.29 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  36.45 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.84 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.74 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  36.94 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  34.25 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  37.61 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.68 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  39.04 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>