More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3909 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  100 
 
 		 240 aa  497  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  94.17 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  92.08 
 
 		 240 aa  463  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  92.5 
 
 		 240 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  68.6 
 
 		 237 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  60.17 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  57.08 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  57.08 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  57.08 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  57.08 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  57.08 
 
 		 239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  55.42 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  55.42 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  55.42 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  55.42 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  55.42 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  55.42 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  55.42 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  55.42 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  44.4 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  43.97 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  44.4 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  43.97 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  43.97 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  44.14 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  43.53 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  42.98 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  44.59 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1119  response regulator  41.08 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  42.74 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  42.99 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  36.56 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  35.24 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  37.05 
 
 		 222 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  37.05 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.16 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1922  response regulator  36.52 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  35.93 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.28 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  35.34 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  39.04 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  38.33 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.24 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.66 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  38.46 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.93 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  35.11 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.12 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.03 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.12 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.12 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  36.56 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  35.24 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.92 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  32.74 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  35.06 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  33.04 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  34.38 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  35.96 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  32.74 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  35.4 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  32.75 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  33.48 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  32.75 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  31.72 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  32.47 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  32.61 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  31.72 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  34.8 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.72 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  32.75 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.16 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  31.6 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  32.89 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  37.18 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  33.92 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.72 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  35.9 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  31.28 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  32.78 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  33.04 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  32.33 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  31.56 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  35.06 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  31.11 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  31.11 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  31.11 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  33.48 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.14 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>