More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3992 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  100 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  58.11 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  51.53 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  47.6 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  48.02 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  47.53 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  48.67 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  48.87 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  47.53 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  45.81 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  45.37 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  45.37 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  45.13 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  44.93 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  45.09 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  42.92 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.44 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  40.81 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  40.99 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.09 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.09 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  40.99 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.36 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  38.67 
 
 		 241 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  39.27 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  37.39 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  37.67 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  42.6 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.2 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  37.67 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.12 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  37.67 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  37.67 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3379  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.89 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.440522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  38.64 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  36.68 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.24 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.16 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  36.4 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  38.01 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  37.56 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  37.44 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.64 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.64 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  37.56 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  37.56 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.18 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  37.1 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.56 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  36.94 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0057  transcriptional regulator CitB  37.05 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.651756 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  37.1 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  40.44 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  37.1 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0057  transcriptional regulator CitB  37.05 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743375  normal  0.317361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.73 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0056  transcriptional regulator CitB  37.05 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0058  transcriptional regulatory protein CitB  37.05 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0059  transcriptional regulatory protein CitB  37.05 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.98 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.08 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  35.43 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.55 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  35.32 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  37.39 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  34.86 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  35.43 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.28 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.28 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  36.71 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  34.98 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  43.56 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  34.08 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  34.08 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  39.37 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.4 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  34.08 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  36.73 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>