More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3002 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  85.97 
 
 		 221 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  81.36 
 
 		 220 aa  347  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  80.91 
 
 		 220 aa  346  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  80.91 
 
 		 220 aa  346  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  55.25 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  50.68 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  53.6 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  47.98 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  50 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  50.45 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  43.24 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  47 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  44.24 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  43.5 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  47.39 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  41.36 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  42.6 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  40.64 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  47.32 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  40.18 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  40 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  42.34 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  39.3 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  40.91 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  40.45 
 
 		 230 aa  165  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  40.45 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.92 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  47.11 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  40.45 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.54 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  41.74 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  44.74 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  42.73 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  42.04 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.55 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  41.85 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.5 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.5 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.5 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.5 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.5 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  36.53 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  45.25 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.23 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.28 
 
 		 239 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.61 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  38.94 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  38.94 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  38.94 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.94 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.94 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.94 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.94 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.94 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.8 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  33.48 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.36 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  33.19 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  34.84 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  39.39 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  33.94 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.66 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  33.19 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  40.28 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  34.51 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  34.84 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  44.02 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  34.07 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  32.74 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  32.59 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  32.74 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  33.94 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  33.94 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  34.39 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.77 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  44 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  34.84 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  34.39 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  34.39 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  32.74 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.89 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  36.73 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  44.98 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.4 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  33.02 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1119  response regulator  34.07 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  34.55 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0471  response regulator  41.56 
 
 		 159 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  38.1 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  33.64 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  33.64 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.91 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  36.32 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0528  two-component response regulator, citrate/malate, N-terminus  49.14 
 
 		 127 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  35 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  43.95 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.82 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  35.87 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>