More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2225 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  85.29 
 
 		 241 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  78.76 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  78.51 
 
 		 233 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  63.39 
 
 		 229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3379  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  60.35 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.440522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0059  transcriptional regulatory protein CitB  46.49 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0058  transcriptional regulatory protein CitB  46.49 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0057  transcriptional regulator CitB  46.49 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743375  normal  0.317361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0056  transcriptional regulator CitB  46.49 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0057  transcriptional regulator CitB  46.49 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.651756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  42.22 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.2 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  41.74 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  40.37 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  40.37 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  40.37 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  40.37 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.27 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  38.29 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  38.64 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  37.84 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.91 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  36.36 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  35.11 
 
 		 230 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.27 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.84 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  37.84 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.39 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  33.94 
 
 		 226 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  33.94 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.94 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  33.48 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  32.44 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  32.17 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  32.76 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  33.19 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  32.74 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  32.74 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  31.74 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  31.56 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  31.95 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  31.86 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.53 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.53 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  32.46 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.61 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.09 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  34.09 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  34.09 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  34.09 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  34.09 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  33.18 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  33.64 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  33.64 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.32 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  33.64 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  35.14 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  33.64 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  32.03 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.25 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  30.04 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4785  response regulator receiver  32.92 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  32.3 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  29.73 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  31.11 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  32.59 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  33.33 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0349  response regulator receiver  27.52 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  32.14 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  29.52 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  30.63 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.9 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.63 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  28.96 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  30.18 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  27.23 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0471  response regulator  39.5 
 
 		 159 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  27.63 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  28.83 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0528  two-component response regulator, citrate/malate, N-terminus  39.5 
 
 		 127 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1351  response regulator receiver and unknown domain protein  27.8 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  26.82 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  27.68 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  25.57 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  27.35 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.57 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>