More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2020 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 233 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  96.09 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  78.32 
 
 		 241 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  78.51 
 
 		 241 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  62.28 
 
 		 229 aa  301  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3379  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  59.48 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.440522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.3 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0058  transcriptional regulatory protein CitB  43.95 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0059  transcriptional regulatory protein CitB  43.95 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0056  transcriptional regulator CitB  43.95 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0057  transcriptional regulator CitB  43.95 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743375  normal  0.317361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  39.74 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0057  transcriptional regulator CitB  44.2 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.651756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  36.73 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  39.46 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  36.61 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  36.61 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  36.61 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  36.61 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.68 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  37.73 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  36.2 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.61 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  35.68 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.44 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  36.61 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  36.16 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  36.24 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  35.96 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  36.49 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  35.81 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  35.71 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.96 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  30.9 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  32.61 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  33.18 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  31.42 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.18 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  32.73 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.18 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  34.98 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  33.18 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.18 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  32.14 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  30.4 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.75 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.87 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.56 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  34.55 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.29 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  34.09 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  33.64 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  34.09 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  34.09 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  33.64 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  33.64 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  34.09 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  31.14 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  29.86 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  32.27 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  32.59 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  33.19 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0349  response regulator receiver  30.45 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  32.74 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.42 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  28.51 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  29.86 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  30.94 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  31.44 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.43 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  28.7 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4785  response regulator receiver  32.14 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  30.36 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  27.56 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  28.44 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0471  response regulator  43.7 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2305  response regulator receiver and unknown domain protein  29.07 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.96 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0528  two-component response regulator, citrate/malate, N-terminus  43.7 
 
 		 127 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1351  response regulator receiver and unknown domain protein  27.43 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  28.83 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  29.78 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  27.6 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.02 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.82 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  28.05 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  28.89 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  27.6 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  27.6 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>