More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1351 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1351  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 		 220 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4785  response regulator receiver  53.46 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  45.21 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.66 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  37.07 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  41.82 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  39.46 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  37.39 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.73 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.78 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  35.09 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  30.63 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  37.05 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  33.93 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.01 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  38.74 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  37.95 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  34.08 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.56 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  35.87 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  32.74 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  30.49 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.19 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  30.97 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  30.8 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.04 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.04 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  37.67 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  31.11 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  31.11 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  31.11 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.11 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  28.18 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  35.71 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  34.25 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  35.44 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  27.93 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.78 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.43 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.78 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.78 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.78 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.78 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  30.04 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.91 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  39.27 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3379  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.49 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.440522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  36.2 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  27.73 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  29.2 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  36.02 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.46 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.39 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  27.06 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1922  response regulator  26.01 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  34.35 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  28.44 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  28.88 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  26.61 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  29 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  28.64 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  37 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  26.61 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  26.61 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  27.43 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  33.04 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.43 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  26.61 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  26.61 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  26.61 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.04 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  28.38 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1119  response regulator  27.51 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  27.75 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.74 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  31.74 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  26.36 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  28.38 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  28.26 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  28.45 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  27.63 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.7 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  29.33 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  27.8 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  29.78 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  26.15 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  29.78 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  29.78 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.82 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  26.22 
 
 		 235 aa  92.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  27.19 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  27.03 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>