More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8064 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  51.98 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  53.18 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  54.19 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  51.79 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  54.15 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  52.19 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  52.23 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  49.79 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  53.6 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  50.91 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  52.83 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  52.94 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  51.82 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  51.82 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  51.82 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  50.45 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  49.77 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  45.81 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  43.35 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  39.91 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  45.25 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  47.75 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.48 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  40.09 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  45.85 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.05 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  41.26 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  43.64 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  40.62 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.1 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.38 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  40.91 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  38.46 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  35.24 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  35.24 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  42.41 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  34.8 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  34.8 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.09 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  34.8 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  47.3 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  37.9 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.74 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.84 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  34.36 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  33.78 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  32.89 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  34.82 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  40 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.33 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1351  response regulator receiver and unknown domain protein  41.82 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.98 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  34.26 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  32.43 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  31.11 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  38.67 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  36.04 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  32.43 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.56 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  32.43 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  33.18 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  32.43 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  32.58 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  33.03 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4698  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.23 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.423451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  32.74 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.56 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.84 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.12 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0520  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.5 
 
 		 272 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2037  response regulator receiver  38.33 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  32.58 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  40.43 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.52 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.52 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.52 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.52 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.52 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.93 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  33.19 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  35.37 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  35.37 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.37 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.09 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.37 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.37 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.37 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  35.37 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.37 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>