More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0930 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  98.67 
 
 		 226 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  97.79 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  97.35 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  97.79 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  95.58 
 
 		 226 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  44.34 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  46.43 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.89 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  44.39 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.5 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  44.2 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.81 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  38.6 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  37.95 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  41.18 
 
 		 227 aa  165  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.55 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  39.11 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  38.29 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  39.11 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  38.74 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  38.67 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  38.29 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  38.29 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  34.68 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  37.1 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  34.25 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  37.1 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  35.43 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  34.7 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  36.65 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  36.65 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  34.25 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  34.25 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  33.33 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  33.79 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  32.29 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.27 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0057  transcriptional regulator CitB  34.09 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743375  normal  0.317361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0058  transcriptional regulatory protein CitB  34.09 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0056  transcriptional regulator CitB  34.09 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0059  transcriptional regulatory protein CitB  34.09 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0057  transcriptional regulator CitB  33.64 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.651756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2326  response regulator receiver and unknown domain protein  33.94 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.46 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  33.48 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.02 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  32.3 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  35.14 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  34.82 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.72 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  33.94 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  32.73 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.84 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3379  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.86 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.440522 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.28 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32.16 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.78 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.09 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.09 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.09 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.09 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  29.09 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0349  response regulator receiver  30.14 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  34.5 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1119  response regulator  30.91 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.45 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.84 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  33.48 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  33.04 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  34.93 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  28.64 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  28.64 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.64 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.64 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.64 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.64 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  28.64 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.64 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.48 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  34.98 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.08 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.78 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.08 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.16 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.08 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  31.14 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  29.41 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  34.2 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>