More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0640 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0640  response regulator  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  94.04 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  94.47 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  94.04 
 
 		 235 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  94.04 
 
 		 235 aa  456  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  94.47 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  94.04 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  92.34 
 
 		 235 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  93.75 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  80.43 
 
 		 235 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  51.11 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  43.4 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  45.05 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  45.05 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.98 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  44.64 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  42.04 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  42.04 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  42.04 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  41.59 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.04 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.54 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.54 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.54 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.54 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  42.54 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.65 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  35.94 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  35.94 
 
 		 222 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  35.14 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  36.44 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  34.93 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.25 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1922  response regulator  37.89 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  34.86 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  36.94 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1119  response regulator  34.38 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  34.36 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.94 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  34.5 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  32.43 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  33.49 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  34.4 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.27 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  33.94 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  33.93 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  33.94 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  33.94 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  33.78 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  34.55 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  37.73 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  33.04 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.74 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  33.03 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  31.39 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  34.22 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.04 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.04 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.25 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  29.09 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.49 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  32 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.6 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0196  response regulator receiver and unknown domain protein  30.53 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  29.13 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  30.41 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.03 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.7 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  29.82 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  31.96 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.73 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  30.4 
 
 		 231 aa  118  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  30.6 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  29.46 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  32.02 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  28.96 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  29.57 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  29.73 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.64 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  29.46 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  29.02 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  29.02 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  29.02 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  29.36 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000367941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  29.02 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  29.02 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  29.02 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  29.73 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  28.77 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  32.05 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  28.89 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2037  response regulator receiver  31.25 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  28.89 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.22 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>