More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1257 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1257  response regulator receiver  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  34.06 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  36 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  34.06 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  38.84 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  35.29 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.8 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  36.12 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  35.11 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  32.74 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  35.65 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.67 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  34.23 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  30.13 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  33.92 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  29.52 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  28.63 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  30.13 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  33.19 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32.75 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  34.98 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  33.33 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  29.69 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  29.69 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  28.82 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  33.33 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  32.02 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  31.14 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  36.49 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  32.88 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  32.88 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  38.57 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  29.26 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.65 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  35.75 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.75 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.79 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  30.7 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  33.78 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  29.2 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  34.67 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  35.27 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  30.7 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.26 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  35.75 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  32.43 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  35.23 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1922  response regulator  27.9 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0349  response regulator receiver  28.18 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.2 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  24.89 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0699  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.09 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1452  response regulator receiver and unknown domain protein  31.05 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  31.11 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  34.01 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  30.94 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.32 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.78 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  35.87 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  30.67 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2791  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.46 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00727267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  32.29 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  30.53 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  31.44 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  28.76 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  31.34 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  36.36 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  30.67 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  33.18 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000318963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.11 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  31.91 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  30.67 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.4 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  32.9 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  33.77 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  33.79 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  31.36 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  26.11 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  26.11 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  26.11 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  26.11 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  26.11 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  26.11 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  26.11 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  26.11 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  27.85 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  27.85 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>