More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2077 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1082 aa  2194    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  99.91 
 
 
1082 aa  2192    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
1082 aa  2194    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4626  two-component regulatory system sensor kinase  53.52 
 
 
983 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.23 
 
 
1129 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  35.42 
 
 
1156 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6941  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1169 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0447401  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4270  histidine kinase  33.12 
 
 
1175 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2983  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
1167 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  31.35 
 
 
1122 aa  300  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
936 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.81 
 
 
915 aa  287  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  33.9 
 
 
936 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.69 
 
 
948 aa  286  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.69 
 
 
948 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.69 
 
 
948 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  32.14 
 
 
935 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.69 
 
 
948 aa  283  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
925 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.94 
 
 
949 aa  282  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.9 
 
 
955 aa  282  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.65 
 
 
949 aa  283  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.65 
 
 
949 aa  282  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.65 
 
 
949 aa  282  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.65 
 
 
949 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.65 
 
 
949 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.65 
 
 
933 aa  281  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  28.65 
 
 
949 aa  281  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  28.65 
 
 
933 aa  281  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
1074 aa  280  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.47 
 
 
949 aa  280  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.76 
 
 
951 aa  279  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.71 
 
 
951 aa  278  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29 
 
 
934 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  33.13 
 
 
931 aa  270  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  29.62 
 
 
1084 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
1070 aa  265  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  31.57 
 
 
1083 aa  261  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1032 aa  258  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.45 
 
 
957 aa  257  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.45 
 
 
949 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.45 
 
 
949 aa  257  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  31.15 
 
 
1098 aa  249  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1022 aa  248  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  28.2 
 
 
1053 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1029 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3285  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
1034 aa  244  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  28.85 
 
 
1014 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  29.13 
 
 
988 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  31.67 
 
 
774 aa  241  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  34.85 
 
 
785 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  28.7 
 
 
1032 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  34.65 
 
 
785 aa  237  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
782 aa  237  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  34.51 
 
 
786 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4693  histidine kinase  29.92 
 
 
1120 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.027571  hitchhiker  0.0000750184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  30.1 
 
 
952 aa  232  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  34.71 
 
 
951 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  33.66 
 
 
785 aa  230  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
1436 aa  230  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
1266 aa  229  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1436 aa  226  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
1340 aa  226  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1002 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1003 aa  226  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  31.69 
 
 
1626 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  28.02 
 
 
1064 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.87 
 
 
1331 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1255 aa  222  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1009 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
1001 aa  221  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1303 aa  220  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
1005 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 
833 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
1426 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 
1692 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  30.87 
 
 
994 aa  214  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
738 aa  213  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1768 aa  212  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 
1765 aa  212  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  32.97 
 
 
1309 aa  212  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
909 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  30.43 
 
 
1042 aa  211  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
1490 aa  211  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
929 aa  211  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  32.1 
 
 
1135 aa  211  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  30.59 
 
 
833 aa  211  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  26.31 
 
 
1683 aa  210  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0909  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
1333 aa  210  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  30.21 
 
 
942 aa  210  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
1245 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
1310 aa  209  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1236 aa  209  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  30.15 
 
 
891 aa  209  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1238 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
1326 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1234 aa  208  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1236 aa  208  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
1258 aa  208  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1236 aa  208  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>