More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2144 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2144  response regulator receiver protein  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0205  response regulator receiver protein  52.24 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1271  response regulator receiver protein  45.04 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2148  response regulator receiver protein  47.73 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1833  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1710  response regulator receiver protein  40.56 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1609  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4403  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3148  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  34.4 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1333 aa  68.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 381 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  34.4 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 618 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.12 
 
 		 918 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  34.96 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  36.13 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 807 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  35.2 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1177 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 1310 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 623 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 395 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1121 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 663 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.65 
 
 		 929 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.04 
 
 		 863 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 		 811 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 657 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1159 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 782 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3353  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1097  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 		 391 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  34.4 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0912  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.33 
 
 		 371 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  34.68 
 
 		 932 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  33.86 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  34.56 
 
 		 982 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  33.33 
 
 		 1141 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  30.47 
 
 		 802 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1033 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  35.77 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1352 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  33.6 
 
 		 384 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.14 
 
 		 927 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  33.83 
 
 		 1287 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 984 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 1816 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  36.36 
 
 		 365 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 		 1686 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0836  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 395 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  35.77 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 930 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.83 
 
 		 933 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 944 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 346 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 944 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.5 
 
 		 950 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.4 
 
 		 457 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.81 
 
 		 404 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2032  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.05 
 
 		 310 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 873 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 395 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 391 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 2654 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  37.61 
 
 		 352 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1681 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 392 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  34.13 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.71 
 
 		 932 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1009 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  31.15 
 
 		 779 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1356 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 920 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1681 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1155 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3005  response regulator receiver  34.82 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.931132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2262  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.55 
 
 		 853 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1195 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  31.15 
 
 		 786 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>