More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2331 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  66.45 
 
 
785 aa  978    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  66.19 
 
 
785 aa  984    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  62.34 
 
 
783 aa  942    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  62.13 
 
 
796 aa  948    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  67.57 
 
 
778 aa  1029    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
779 aa  1558    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  66.32 
 
 
785 aa  974    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  67.1 
 
 
785 aa  1014    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  64.25 
 
 
772 aa  929    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  93.52 
 
 
786 aa  1400    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  71.91 
 
 
787 aa  1040    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 
782 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
818 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  38.23 
 
 
1014 aa  347  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  41.03 
 
 
1346 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
921 aa  339  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.26 
 
 
833 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
818 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.99 
 
 
923 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1202 aa  331  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.59 
 
 
1177 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
977 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1040 aa  321  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
1284 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
1550 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  38.86 
 
 
1287 aa  320  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
909 aa  320  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1118 aa  318  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
1057 aa  317  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  37.5 
 
 
1021 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
812 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
833 aa  311  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.52 
 
 
1331 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  35.61 
 
 
905 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1397 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.27 
 
 
847 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
914 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
835 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
981 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  38.9 
 
 
727 aa  304  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.85 
 
 
1763 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
1310 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
1611 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
990 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.8 
 
 
1442 aa  303  9e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
758 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
957 aa  303  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1398 aa  303  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
1305 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1326 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
1498 aa  302  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
912 aa  301  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
922 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  36.03 
 
 
931 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
738 aa  301  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
1240 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.48 
 
 
1499 aa  301  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1240 aa  301  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
916 aa  300  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  40.22 
 
 
918 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
1042 aa  300  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  36.88 
 
 
925 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
929 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1316 aa  299  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.9 
 
 
1135 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  38.83 
 
 
977 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  40.88 
 
 
918 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
1363 aa  299  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1768 aa  298  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
925 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
1165 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
1033 aa  297  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
899 aa  296  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  34 
 
 
929 aa  296  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  37.48 
 
 
737 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
950 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.45 
 
 
929 aa  296  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 
816 aa  295  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  39.58 
 
 
914 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  33.38 
 
 
917 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
916 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.82 
 
 
1653 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.03 
 
 
933 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
985 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  33.67 
 
 
1351 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.58 
 
 
1109 aa  295  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.42 
 
 
917 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
1255 aa  294  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 
705 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
1245 aa  294  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
1765 aa  293  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  36.64 
 
 
925 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.13 
 
 
927 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
1166 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1267 aa  292  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
991 aa  292  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  34.4 
 
 
932 aa  291  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  38.66 
 
 
955 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
1333 aa  290  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
993 aa  290  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>