More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2207 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2207  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  45.83 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 947 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  45.87 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  42.59 
 
 		 1060 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 1287 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1271 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 392 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 1331 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 233 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  45.37 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  39.34 
 
 		 961 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.2 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  40.5 
 
 		 685 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  47.27 
 
 		 847 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.48 
 
 		 763 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 981 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 1007 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 		 956 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 1415 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 397 aa  81.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 870 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 907 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1284 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1274 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 1362 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 1142 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1426 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1923  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 569 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 917 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  40.71 
 
 		 1287 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  40.98 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  40.74 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 1611 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 391 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  38.1 
 
 		 598 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 1431 aa  77.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  40.74 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 688 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  0.0000928264 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 990 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 1299 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 846 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 835 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 964 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1303 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  42.59 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 920 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 1002 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1788 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1977 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  40.74 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1158 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  40.74 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  41.67 
 
 		 1170 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  41.67 
 
 		 1172 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 827 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.61 
 
 		 922 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  40.74 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.81 
 
 		 1331 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  39.34 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 696 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>