More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0501 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0501  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  290  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3630  response regulator receiver protein  49.61 
 
 		 138 aa  140  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  41.72 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0049  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  38.19 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2711  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3022  response regulator receiver domain-containing protein  39.71 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0385  two component response regulator  39.44 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2429  response regulator receiver  39.71 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148987  normal  0.0115223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4874  response regulator receiver  40.44 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2871  response regulator receiver domain-containing protein  38.97 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281893  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5359  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5415  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  36.69 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4218  putative two-component response regulator/receiver (CheY-like protein)  37.5 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2535  response regulator  42.48 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0299  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524886  hitchhiker  0.00620929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2785  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1755  response regulator receiver  38.24 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131899  normal  0.135934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2334  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1782  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.750495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0149  CheY-like receiver protein  37.5 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0092  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2191  response regulator receiver domain-containing protein  36.76 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1342  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5953  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  36.69 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  35.29 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  35.71 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  34.15 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  29.53 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  31.62 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  32.56 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 523 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  33.79 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  32.85 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  35.71 
 
 		 457 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  35.71 
 
 		 457 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0100  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 870 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  30.88 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  34.82 
 
 		 457 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  31.34 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  30.61 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2050  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 511 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.155124  hitchhiker  0.000156568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  35.09 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  46.48 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.48 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0384  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.09 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 		 377 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  34.21 
 
 		 455 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>