More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1861 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1861  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2701  two component transcriptional regulator, winged helix family  90.67 
 
 		 225 aa  410  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3959  two component transcriptional regulator  60.29 
 
 		 225 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.149176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2140  two component transcriptional regulator  56.67 
 
 		 226 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  45.66 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.92 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.92 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.92 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  45.16 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  44.19 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.44 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.64 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.83 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.95 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.91 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  40.91 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  40.91 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.06 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  44.7 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.71 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.93 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.93 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.59 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  45.16 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  43.46 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.7 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  44.7 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.7 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.13 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.7 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  44.7 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.13 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.7 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.7 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.13 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 220 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.13 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.13 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  40.47 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  39.91 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  41.46 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  41.46 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3910  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.598174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.37 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  38.89 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.66 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.2 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  40.47 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  40.47 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.47 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  40.47 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  41.59 
 
 		 221 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  37.16 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>